Ο Α.Σ. Προφήτη Ηλία διοικείται από 5μελές Διοικητικό Συμβούλιο το οποίο λογοδοτεί κάθε έτος στη Γενική Συνέλευση η οποία αποτελεί και το ανώτατο όργανο του Συνεταιρισμού.
Η διαχείριση του Συνεταιρισμού ελέγχεται τακτικά ή αιφνιδιαστικά και από αρμόδια εθνικά και κοινοτικά όργανα.
